RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	PTP4A1	Q93096	173 aa		15.69	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	NACC2	Q96BF6	587 aa		15.69	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		15.69	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		15.69	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	RNF31	Q96EP0	1072 aa		15.69	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		15.69	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	POLE3	Q9NRF9	147 aa		15.69	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		15.69	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		15.69	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	C2orf74	A8MZ97	194 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	MYL9	P24844	172 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	MTNR1B	P49286	362 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	FOXK2	Q01167	660 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	GALE	Q14376	348 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	AMZ1	Q400G9	498 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ZFP69	Q49AA0	526 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	CA13	Q8N1Q1	262 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	FRMD6	Q96NE9	622 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	CSF2	P04141	144 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFA5	Q16718	116 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF613	Q6PF04	617 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	CDK20	Q8IZL9	346 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	MARCH7	Q9H992	704 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	MALT1	Q9UDY8	824 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	MED31	Q9Y3C7	131 aa		15.68	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	F5	P12259	2224 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	DAPL1	A0PJW8	107 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	SLC19A2	O60779	497 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	PTP4A3	O75365	173 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	DRD5	P21918	477 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	BMP8B	P34820	402 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	GABRA3	P34903	492 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	MAP2K3	P46734	347 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	YPEL5	P62699	121 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	TRIQK	Q629K1	86 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ZAR1	Q86SH2	424 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ENKUR	Q8TC29	256 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	PATE1	Q8WXA2	126 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF559	Q9BR84	538 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	NKX2-2	O95096	273 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	CD53	P19397	219 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	IL18	Q14116	193 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	TRIL	Q7L0X0	811 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	TBX5	Q99593	518 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	TEAD3	Q99594	435 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	KCNJ15	Q99712	375 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	IFT27	Q9BW83	186 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	POT1	Q9NUX5	634 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		15.67	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058		A0A0J9YY10	115 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	FAM172BP	A6NC97	362 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	RFPL3	O75679	317 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	FAM157B	P0CG42	384 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	IL9	P15248	144 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	SLC2A5	P22732	501 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	TFF2	Q03403	129 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	QPRT	Q15274	297 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058	ART5	Q96L15	291 aa		15.66	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058		A0A0B4J2E0	115 aa		15.65	■□□□□ 0.1
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1B0GX12	115 aa		15.65	■□□□□ 0.1

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