RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 GPRIN2O60269 458 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF253O75346 499 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 GJB5O95377 273 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 OPN1LWP04000 364 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PCCBP05166 539 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PPIAL4GP0DN37 164 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ANXA3P12429 323 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 DRD5P21918 477 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ARFIP1P53367 373 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ANKDD1AQ495B1 522 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SLC36A3Q495N2 470 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 NCR3LG1Q68D85 454 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 P2RY8Q86VZ1 359 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 IFNEQ86WN2 208 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 MARCH9Q86YJ5 346 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF671Q8TAW3 534 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 AGAP11Q8TF27 550 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 FOXN4Q96NZ1 517 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 NFKBIZQ9BYH8 718 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TIGARQ9NQ88 270 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 EHFQ9NZC4 300 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SLIT3O75094 1523 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 USP32Q8NFA0 1604 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 LRRK1Q38SD2 2015 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 KNDC1Q76NI1 1749 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TNS2Q63HR2 1409 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 A0A087WWV3 80 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 GSAPA4D1B5 854 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SAP18O00422 153 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TBX19O60806 448 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 STX11O75558 287 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 MBD3O95983 291 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 EPB41P11171 864 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 RFC4P35249 363 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 HMGCLP35914 325 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 RPL4P36578 427 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 DLSTP36957 453 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ALDH3B2P48448 385 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 IL18R1Q13478 541 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CYP51A1Q16850 503 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 C15orf32Q32M92 178 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 EIPR1Q53HC9 387 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 MEDAGQ5VYS4 303 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SLX4IPQ5VYV7 408 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SPINK14Q6IE38 97 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 GCNT7Q6ZNI0 430 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D21Q8IYX1 336 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 OR2T34Q8NGX1 318 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 THRSPQ92748 146 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 VPS39Q96JC1 886 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 AKR1E2Q96JD6 320 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 APOL2Q9BQE5 337 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TEX13BQ9BXU2 312 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 GSDMCQ9BYG8 508 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PRODH2Q9UF12 536 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SMC3Q9UQE7 1217 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SPACA6W5XKT8 324 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 FRMPD3Q5JV73 1810 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ATP10DQ9P241 1426 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PPIAL4DF5H284 164 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 G3V3Y1 287 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 BCL2L11O43521 198 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ALPIP09923 528 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 UMPSP11172 480 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PDHBP11177 359 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 LAMP1P11279 417 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 OTX2P32243 289 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 RND3P61587 244 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PUDPQ08623 228 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TATDN3Q17R31 274 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 Q1RN00 199 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 NADK2Q4G0N4 442 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 OLFML2AQ68BL7 652 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 LANCL3Q6ZV70 420 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TTC5Q8N0Z6 440 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 BPIFB2Q8N4F0 458 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 NANPQ8TBE9 248 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 VN1R17PQ8TDU5 208 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CRACR2AQ9BSW2 395 aa2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms