RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 SIGLEC7Q9Y286 467 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SLC22A7Q9Y694 548 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 APODP05090 189 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ACSL1P33121 698 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 RUNX2Q13950 521 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 FBXO42Q6P3S6 717 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 CREB3L2Q70SY1 520 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 OR10H4Q8NGA5 316 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 NACC2Q96BF6 587 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TEAD3Q99594 435 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 EVA1AQ9H8M9 152 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 RASD1Q9Y272 281 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TNFSF14O43557 240 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 B3GALT2O43825 422 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 AK1P00568 194 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SBK2P0C263 348 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TFPIP10646 304 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 FUT1P19526 365 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ARL9Q6T311 187 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 THSD4Q6ZMP0 1018 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 CDRT4Q8N9R6 151 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 OR7G1Q8NGA0 311 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ART5Q96L15 291 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ADGRL4Q9HBW9 690 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 C14orf105Q9NVL8 296 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 KCNE5Q9UJ90 142 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 BAIAP2Q9UQB8 552 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXD1-201ENST00000331462 PRSS38A1L453 326 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 C7orf66A4D0T2 115 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 E9PI62 339 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 ERVH48-1M5A8F1 160 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 P2RX6O15547 441 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 LANCL1O43813 399 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 PAHP00439 452 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 ATP1B1P05026 303 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 PTNP21246 168 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 PYHIN1Q6K0P9 492 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 SLC43A2Q8N370 569 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 SAMD12Q8N8I0 201 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 ABHD4Q8TB40 342 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 DEDD2Q8WXF8 326 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 BPIFA2Q96DR5 249 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 PGLYRP3Q96LB9 341 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 TBX5Q99593 518 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 LYRM4Q9HD34 91 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 MED31Q9Y3C7 131 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 URADA6NGE7 173 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 GKN3PP0CG01 181 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 LAMP2P13473 410 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 IL9P15248 144 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 AHCYP23526 432 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 BMP8BP34820 402 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 BTCP35070 178 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 MAP3K8P41279 467 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 ACTC1P68032 377 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 ACTA1P68133 377 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 C19orf57Q0VDD7 668 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 KIR2DS3Q14952 304 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 AMZ1Q400G9 498 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF613Q6PF04 617 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF767PQ75MW2 155 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 OR4N5Q8IXE1 308 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 CDK20Q8IZL9 346 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 GHDCQ8N2G8 530 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 OR13C2Q8NGS9 318 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 IFT27Q9BW83 186 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 RIIAD1A6NNX1 92 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 PTP4A3O75365 173 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 EML2O95834 649 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 EVI2BP34910 448 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 E2F1Q01094 437 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF85Q03923 595 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 BTBD16Q32M84 506 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 DEFB134Q4QY38 66 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 KLHL12Q53G59 568 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 HYLS1Q96M11 299 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 POLE3Q9NRF9 147 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD1-201ENST00000331462 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms