RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM150CB9EJG8 249 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-201ENST00000246533 FGF11Q92914 225 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-201ENST00000246533 SYT14P1Q58G82 188 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM164Q5U3C3 297 aa24.38■■□□□ 1.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa24.37■■□□□ 1.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 C22orf42Q6IC83 251 aa24.37■■□□□ 1.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf18Q8NEA5 215 aa24.37■■□□□ 1.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 DCBLD2Q96PD2 775 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PRRG3Q9BZD7 231 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ULBP3Q9BZM4 244 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC14L3Q9UDX4 400 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
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