RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639956.1

SPIN3-232, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,998 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-232ENST00000639956 ACTR1AP61163 376 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 PPP2CBP62714 309 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 PPP2CAP67775 309 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 RUNX3Q13761 415 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 GNA13Q14344 377 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ZIC1Q15915 447 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 CCDC58Q4VC31 144 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 MFSD12Q6NUT3 480 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 CEACAM19Q7Z692 300 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 AMIGO1Q86WK6 493 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 OR2L8Q8NGY9 312 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 SNAPC3Q92966 411 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 TEX101Q9BY14 249 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 SLC17A9Q9BYT1 436 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 FN3KQ9H479 309 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ADAM29Q9UKF5 820 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 RGS13O14921 159 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 RNF13O43567 381 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 GMFGO60234 142 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 CTSVO60911 334 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 PPP1R3DO95685 299 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 PRKCAP17252 672 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 FXYD6P3P58550 94 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 FZD5Q13467 585 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 DEFB110Q30KQ9 67 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM35AQ53FP2 167 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 FAM205BPQ63HN1 556 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 NRROSQ86YC3 692 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ACBD7Q8N6N7 88 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 C4orf36Q96KX1 117 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ARHGDIGQ99819 225 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ORAI3Q9BRQ5 295 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 TEX12Q9BXU0 123 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 HDAC8Q9BY41 377 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ABCG5Q9H222 651 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 IL20Q9NYY1 176 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF222Q9UK12 451 aa11.6□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 CFAP54Q96N23 3096 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 GXYLT2A0PJZ3 443 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 NOTOA8MTQ0 251 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 RFPL3O75679 317 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 RASGRP1O95267 797 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 CA3P07451 260 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 CPMP14384 443 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ARSBP15848 533 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 GDI1P31150 447 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 TP53I3Q53FA7 332 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 SSX6Q7RTT6 188 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 YAF2Q8IY57 180 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 GPR135Q8IZ08 494 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 POGLUT1Q8NBL1 392 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF649Q9BS31 505 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 GPR174Q9BXC1 333 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 SRMSQ9H3Y6 488 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 UCKL1Q9NWZ5 548 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 NLGN3Q9NZ94 848 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 NPAP1Q9NZP6 1156 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 KCNE5Q9UJ90 142 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ERVH48-1M5A8F1 160 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 FCER2P06734 321 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 LAMP2P13473 410 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 MLC1Q15049 377 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 OR1Q1Q15612 314 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 LYPD4Q6UWN0 246 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 PRSS45Q7RTY3 260 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 OR4D9Q8NGE8 314 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 OR52L1Q8NGH7 329 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 PIGKQ92643 395 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 CD180Q99467 661 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 SDF2Q99470 211 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM43Q9BTV4 400 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM168Q9H0V1 697 aa11.59□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 UNC119BA6NIH7 251 aa11.58□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 EFCAB14O75071 495 aa11.58□□□□□ -0.55
SPIN3-232ENST00000639956 CTSBP07858 339 aa11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms