RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622814.4

IRX4-208, Transcript of iroquois homeobox 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRX4, Length 2,398 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRX4-208	ENST00000622814	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CCDC182	A6NF36	153 aa		18.8	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814		B4DXG7	233 aa		18.8	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	AGR2	O95994	175 aa		18.8	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SLC16A1	P53985	500 aa		18.8	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PPP1CA	P62136	330 aa		18.8	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TMEM239	Q8WW34	195 aa		18.8	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	MED17	Q9NVC6	651 aa		18.8	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		18.8	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814		A6NCN8	305 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	STX11	O75558	287 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	HLA-DPB1	P04440	258 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	HMGN1	P05114	100 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TBXA2R	P21731	343 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PLAUR	Q03405	335 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	NIPAL3	Q6P499	406 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	DTX3	Q8N9I9	347 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TIMP4	Q99727	224 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CLDND1	Q9NY35	253 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	HCRTR1	O43613	425 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	IDH3B	O43837	385 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	LYPD3	O95274	346 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CLU	P10909	449 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PPP3R1	P63098	170 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	IL18	Q14116	193 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	EIPR1	Q53HC9	387 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814		Q8N402	240 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF614	Q8N883	585 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	OR52N1	Q8NH53	320 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CD180	Q99467	661 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SPTB	P11277	2137 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814		J3QRE1	110 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	BHLHE40	O14503	412 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CHST10	O43529	356 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TNFSF14	O43557	240 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CTSB	P07858	339 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	GABRA3	P34903	492 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ALG11	Q2TAA5	492 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ABHD13	Q7L211	337 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ALG8	Q9BVK2	526 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CDHR4	A6H8M9	788 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	RFPL3	O75679	317 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	THBS1	P07996	1170 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	NID1	P14543	1247 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	NOS3	P29474	1203 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	OR51A7	Q8NH64	312 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TP53INP1	Q96A56	240 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	IFT27	Q9BW83	186 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SPEG	Q15772	3267 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	RNF13	O43567	381 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CTBP2	P56545	445 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	HYAL1	Q12794	435 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SHH	Q15465	462 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZFP69	Q49AA0	526 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6

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