RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298552.7

TSC1-201, Transcript of TSC complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSC1, Length 8,604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1-201ENST00000298552 NADK2Q4G0N4 442 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 FAM227AF5H4B4 570 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 CHRNA1P02708 482 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 PNMTP11086 282 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ADH5P11766 374 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ZNF30P17039 623 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ETV1P50549 477 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 NUBP1P53384 320 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ERASQ7Z444 233 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 SLC35G3Q8N808 338 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 LMX1AQ8TE12 382 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 EID2BQ96D98 161 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 NPAS1Q99742 590 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 HES7Q9BYE0 225 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.13□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ABCC3O15438 1527 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 SPINT2O43291 252 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 CXCL14O95715 111 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 PPP3CBP16298 524 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 PTNP21246 168 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 CASP7P55210 303 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 GALEQ14376 348 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 XKR5Q6UX68 686 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 TRABD2AQ86V40 505 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 OR5B3Q8NH48 314 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ALG3Q92685 438 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 REEP6Q96HR9 211 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 SENP8Q96LD8 212 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ARHGDIGQ99819 225 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 TPSB2P20231 275 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 PRSS3P35030 304 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 SPEM2Q0P670 501 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 TPSAB1Q15661 275 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 MICAQ29983 383 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 PRELID2Q8N945 189 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 NMES1Q9C002 83 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 MMP28Q9H239 520 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 VPS29Q9UBQ0 182 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 RFXAPO00287 272 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 SGPL1O95470 568 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 SERPINA5P05154 406 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 QDPRP09417 244 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 MYOGP15173 224 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 MAP2K3P46734 347 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 OR3A1P47881 315 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ARSFP54793 590 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 BACE1P56817 501 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 NSDHLQ15738 373 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 Q3ZCU0 254 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ALG8Q9BVK2 526 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 HES4Q9HCC6 221 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 WNT9AO14904 365 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 RFPL3O75679 317 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ABOP16442 354 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 UNC50Q53HI1 259 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 SERINC5Q86VE9 423 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ZNF416Q9BWM5 594 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 C1orf198Q9H425 327 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSC1-201ENST00000298552 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms