RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 CCR9P51686 369 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GMFBP60983 142 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GGTLC2Q14390 218 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FCN2Q15485 313 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GARNL3Q5VVW2 1013 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CST9Q5W186 159 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF613Q6PF04 617 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RTL4Q6ZR62 310 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.21□□□□□ -1.26
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CAPNS1-202ENST00000586851 NRROSQ86YC3 692 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 KLBQ86Z14 1044 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR8H3Q8N146 312 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF527Q8NB42 609 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NUP43Q8NFH3 380 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4M2Q8NGB6 313 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2T27Q8NH04 317 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FANK1Q8TC84 345 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR7D2Q96RA2 312 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 F2RL3Q96RI0 385 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MNTQ99583 582 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MCHR1Q99705 422 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 BEX2Q9BXY8 128 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 HDAC8Q9BY41 377 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLITRK2Q9H156 845 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.21□□□□□ -1.26
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CAPNS1-202ENST00000586851 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NANSQ9NR45 359 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TAC3Q9UHF0 121 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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CAPNS1-202ENST00000586851 HMSDA8MTL9 139 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 I3L521 148 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR171O14626 319 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TEX28O15482 410 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OGG1O15527 345 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR1F1O43749 312 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SSNA1O43805 119 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TMPRSS11DO60235 418 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LILRB3O75022 631 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SH3BGRLO75368 114 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 IGF2P01344 180 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 C8AP07357 584 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CLTBP09497 229 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 UCHL1P09936 223 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 F3P13726 295 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PRG2P13727 222 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 IFNGR1P15260 489 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GNSP15586 552 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CTRB1P17538 263 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CTGFP29279 349 aa7.2□□□□□ -1.26
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CAPNS1-202ENST00000586851 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SSTR4P31391 388 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC6A6P31641 620 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PTGS2P35354 604 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 THBS2P35442 1172 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OPRD1P41143 372 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 TGM4P49221 684 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CAPZA1P52907 286 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CASP9P55211 416 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CSNK1G2P78368 415 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SP3Q02447 781 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CAMK2DQ13557 499 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 IL10RAQ13651 578 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.2□□□□□ -1.26
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