RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ACOT9Q9Y305 439 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NME7Q9Y5B8 376 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CPQQ9Y646 472 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RNF222A6NCQ9 220 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 METTL15A6NJ78 407 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SLC22A1O15245 554 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MED6O75586 246 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ADAP1O75689 374 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 AGFG2O95081 481 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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PDCD4-211ENST00000498367 HPXP02790 462 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CSN3P07498 182 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NUDT17P0C025 328 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SCGB1A1P11684 91 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 B4GALT1P15291 398 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 FCARP24071 287 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HTR2CP28335 458 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GABRA5P31644 462 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MPLP40238 635 aa6.68□□□□□ -1.34
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PDCD4-211ENST00000498367 XKP51811 444 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GNG2P59768 71 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 IL10RBQ08334 325 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 BNIP2Q12982 314 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GRIK2Q13002 908 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GAGE1Q13065 139 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NFATC2Q13469 925 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 AQP6Q13520 282 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 POU6F1Q14863 301 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 LTB4RQ15722 352 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TBR1Q16650 682 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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PDCD4-211ENST00000498367 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF385BQ569K4 471 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 BTNL8Q6UX41 500 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SSX6Q7RTT6 188 aa6.68□□□□□ -1.34
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PDCD4-211ENST00000498367 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CALHM1Q8IU99 346 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 LACC1Q8IV20 430 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 EID3Q8N140 333 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 STX19Q8N4C7 294 aa6.68□□□□□ -1.34
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PDCD4-211ENST00000498367 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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PDCD4-211ENST00000498367 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 OR51A7Q8NH64 312 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 OR6X1Q8NH79 312 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM45BQ96B21 275 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RAB39BQ96DA2 213 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RBBP8Q99708 897 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MYOCQ99972 504 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 UCK2Q9BZX2 261 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.68□□□□□ -1.34
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PDCD4-211ENST00000498367 ARL15Q9NXU5 204 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GPR83Q9NYM4 423 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SMPXQ9UHP9 88 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PQD8 194 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC182A6NF36 153 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SHISA7A6NL88 538 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.67□□□□□ -1.34
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