RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFS7	O75251	213 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	RFX3	P48380	749 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNG1	P51959	295 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CASP9	P55211	416 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	DLG1	Q12959	904 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GRTP1	Q5TC63	336 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FADS6	Q8N9I5	356 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	KAT2A	Q92830	837 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	NEUROG1	Q92886	237 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	S100PBP	Q96BU1	408 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	NXNL1	Q96CM4	212 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	BTBD9	Q96Q07	612 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10A4	Q9H209	315 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CUBN	O60494	3623 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBB	P07437	444 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	DANCR	P0C864	163 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CT45A8	P0DMV1	189 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CT45A9	P0DMV2	189 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKCA	P17252	672 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC6A8	P48029	635 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP2	Q05923	314 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GUSBP1	Q15486	140 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	NRF1	Q16656	503 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE3B	Q5TA77	95 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	KLC3	Q6P597	504 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL4	Q8N3J2	472 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PPM1N	Q8N819	430 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP43	Q8NFH3	380 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GLRX2	Q9NS18	164 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	XPR1	Q9UBH6	696 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	VDAC3	Q9Y277	283 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ACOT9	Q9Y305	439 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		9.65	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511		B4DXG7	233 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511		E7ESA3	106 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL13	O43927	109 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	MED14OS	P0DP75	135 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	MTHFD2	P13995	350 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SRD5A1	P18405	259 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GAS1	P54826	345 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVFRD-1	P60508	538 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF844	Q08AG5	666 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TSC22D1	Q15714	1073 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	FXN	Q16595	210 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35F6	Q8N357	371 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10D3	Q8NH80	312 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF675	Q8TD23	568 aa		9.64	□□□□□ -0.87

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