RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299194.5

LRTM2-201, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRTM2, Length 3,688 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM2-201ENST00000299194 ORAI1Q96D31 301 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 ALG8Q9BVK2 526 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 PBX4Q9BYU1 374 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 HOXD1Q9GZZ0 328 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM27Q9HBJ8 222 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 ZSCAN32Q9NX65 697 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 GXYLT2A0PJZ3 443 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 B4DGG1 531 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 P2RX6O15547 441 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 ARHGEF9O43307 516 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 RDH16O75452 317 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 CHRNB1P11230 501 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 MAP2K3P46734 347 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 RUNX2Q13950 521 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 NDUFAF6Q330K2 333 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 MZT2BQ6NZ67 158 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 TIGD4Q8IY51 512 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 ACBD7Q8N6N7 88 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 GPR174Q9BXC1 333 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 TEX101Q9BY14 249 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 SRRQ9GZT4 340 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 UBQLN3Q9H347 655 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 SFXN1Q9H9B4 322 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 NDOR1Q9UHB4 597 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 LIPT1Q9Y234 373 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 A0A0B4J203 849 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 UNC119BA6NIH7 251 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 CTSVO60911 334 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 CDC20Q12834 499 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 FLYWCH1Q4VC44 716 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 TP53I3Q53FA7 332 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 SNAP47Q5SQN1 464 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 OTPQ5XKR4 325 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 MFSD12Q6NUT3 480 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 MZT2AQ6P582 158 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF836Q6ZNA1 936 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF438Q7Z4V0 828 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 OAFQ86UD1 273 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 GAL3ST1Q99999 423 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 MIXL1Q9H2W2 232 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 TRPV5Q9NQA5 729 aa12.09□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa12.08□□□□□ -0.47
LRTM2-201ENST00000299194 RIIAD1A6NNX1 92 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 RPP14O95059 124 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 MSL3P1P0C860 447 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 PIPP12273 146 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 HPGDP15428 266 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 TEAD1P28347 426 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 NTSR1P30989 418 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 PPP1CAP62136 330 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 MINDY4Q4G0A6 757 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 SIRT6Q8N6T7 355 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 TAPBPLQ9BX59 468 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 V9GYH0 126 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 CHD9Q3L8U1 2897 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 CASC3O15234 703 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 CHST10O43529 356 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 HMGN1P05114 100 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 PEPDP12955 493 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 BMP8BP34820 402 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 ADPRHP54922 357 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 OR10A3P58181 314 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 GPR18Q14330 331 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 OR1Q1Q15612 314 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM196Q5HYL7 178 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 VN1R4Q7Z5H5 301 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 SDR9C7Q8NEX9 313 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 HCAR1Q9BXC0 346 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 CFHR5Q9BXR6 569 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 FN3KQ9H479 309 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 ADAM29Q9UKF5 820 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 A0A075B6Q4 140 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 H0YGG7 62 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 IL1AP01583 271 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 RFX2P48378 723 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 TATDN3Q17R31 274 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 PPP2R2DQ66LE6 453 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 OR52E2Q8NGJ4 325 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM239Q8WW34 195 aa12.08□□□□□ -0.48
LRTM2-201ENST00000299194 MS4A4EQ96PG1 132 aa12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms