RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552000.2

HOXB3-213, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB3, Length 466 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-213ENST00000552000 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 MAT2BQ9NZL9 334 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 CD274Q9NZQ7 290 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 MED11Q9P086 117 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 XPR1Q9UBH6 696 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 CFL2Q9Y281 166 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 PLLPQ9Y342 182 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 PSAT1Q9Y617 370 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 SERINC4A6NH21 518 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 E7EQL1 145 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 ABCD4O14678 606 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 TO15178 435 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 CXCL13O43927 109 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 SYNGR4O95473 234 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 TTC4O95801 387 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 OPN1LWP04000 364 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 TUBBP07437 444 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 CSF3P09919 207 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 CCDC166P0CW27 439 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 COL6A2P12110 1019 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 IL12BP29460 328 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 AGTR1P30556 359 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 SERPINB1P30740 379 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 TTKP33981 857 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 KRT20P35900 424 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 PPICP45877 212 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 GAS1P54826 345 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 CORO7P57737 925 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 MAP4K2Q12851 820 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 EFR3AQ14156 821 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 E2F2Q14209 437 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 LTB4RQ15722 352 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 CARTPTQ16568 116 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 FXNQ16595 210 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 SPANXN3Q5MJ09 141 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 LGSNQ5TDP6 509 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 MFSD12Q6NUT3 480 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 TTC27Q6P3X3 843 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 TFAP2EQ6VUC0 442 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 SPATC1Q76KD6 591 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 GGNQ86UU5 652 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 GABRG1Q8N1C3 465 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 TXLNBQ8N3L3 684 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 CEP112Q8N8E3 955 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 NAT8LQ8N9F0 302 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 FADS6Q8N9I5 356 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 OR2M3Q8NG83 312 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 OR52B6Q8NGF0 335 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 OR10D3Q8NH80 312 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 NXNL1Q96CM4 212 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 SLC35A4Q96G79 324 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 HBEGFQ99075 208 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 HDHD5Q9BXW7 423 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 POTEKPQ9BYX7 375 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 TRIM5Q9C035 493 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 ANKRA2Q9H9E1 313 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 ZBTB26Q9HCK0 441 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 CBLN4Q9NTU7 201 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 NPAP1Q9NZP6 1156 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 ASIC3Q9UHC3 531 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 MCM8Q9UJA3 840 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 VWC2LB2RUY7 222 aa4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 H7C417 338 aa4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 GMFGO60234 142 aa4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 TSPAN2O60636 221 aa4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 BPNT1O95861 308 aa4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 ADAP00813 363 aa4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 DRD5P21918 477 aa4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 EVI2BP34910 448 aa4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 PIK3CBP42338 1070 aa4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 NR4A2P43354 598 aa4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 COMPP49747 757 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
HOXB3-213ENST00000552000 EMDP50402 254 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms