RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-208ENST00000512193 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TMEM163Q8TC26 289 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 MED20Q9H944 212 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 HPF1Q9NWY4 346 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 VNN3Q9NY84 501 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SERTAD3Q9UJW9 196 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 PADI2Q9Y2J8 665 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TRIP11Q15643 1979 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 STRCQ7RTU9 1775 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 PAPPAQ13219 1627 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 A0A1B0GVI7 797 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 OR5K4A6NMS3 321 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 LRRTM2O43300 516 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TIMP1P01033 207 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 IL1AP01583 271 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 FUT1P19526 365 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 HHEXQ03014 270 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 POU4F2Q12837 409 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 GRK1Q15835 563 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 MAPK14Q16539 360 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 RAB12Q6IQ22 244 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TMEM17Q86X19 198 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 PDE7BQ9NP56 450 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CD93Q9NPY3 652 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 HSFX1Q9UBD0 423 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 MLXQ9UH92 298 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.57□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 I3L1I5 382 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 AIFM1O95831 613 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 MMP12P39900 470 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 P2RY2P41231 377 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ILKQ13418 452 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 IRF4Q15306 451 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 C12orf40Q86WS4 652 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 MMP21Q8N119 569 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CADM3Q8N126 398 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 LMF1Q96S06 567 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 DUSP21Q9H596 190 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TREM1Q9NP99 234 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TM7SF3Q9NS93 570 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ZNF225Q9UK10 706 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 HYKKA2RU49 373 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 OR2A25A4D2G3 310 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 METTL15A6NJ78 407 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SGK494L7N484 410 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ACP2P11117 423 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CFL1P23528 166 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 CASP3P42574 277 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SOX9P48436 509 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ART1P52961 327 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 S100A10P60903 97 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 PLCXD2Q0VAA5 305 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 LRRC26Q2I0M4 334 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 C18orf63Q68DL7 685 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 GKN2Q86XP6 184 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 C4orf36Q96KX1 117 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 MNTQ99583 582 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 MS4A8Q9BY19 250 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 MCM3APO60318 1980 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 RREB1Q92766 1687 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 K7ESM1 405 aa7.56□□□□□ -1.2
NEK1-208ENST00000512193 KLK8O60259 260 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms