RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 MAU2Q9Y6X3 613 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 NDUFB5O43674 189 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 RAD1O60671 282 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 CSN2P05814 226 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 CD3GP09693 182 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 PBX2P40425 430 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 RHAGQ02094 409 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 POMGNT2Q8NAT1 580 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 OR2W5A6NFC9 320 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 PAHP00439 452 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 HK1P19367 917 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC1A3P43003 542 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 EPHA5P54756 1037 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 BAK1Q16611 211 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 C9orf50Q5SZB4 431 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 ARTNQ5T4W7 220 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 BBS1Q8NFJ9 593 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM239Q8WW34 195 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 GSDMCQ9BYG8 508 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF121Q9H920 327 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAPPC13A5PLN9 417 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 MCIDASD6RGH6 385 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 SMLR1H3BR10 107 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 LYRM1O43325 122 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 AGR2O95994 175 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 TFPIP10646 304 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 CD6P30203 668 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 SELENBP1Q13228 472 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM44Q2T9K0 475 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 SAXO2Q658L1 398 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 GLCCI1Q86VQ1 547 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 ELP4Q96EB1 424 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 DGAT2Q96PD7 388 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PQ72 361 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 ACP2P11117 423 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 F8A1P23610 371 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 SHC1P29353 583 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 UGT2B10P36537 528 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 RACK1P63244 317 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 BNC1Q01954 994 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 TATDN3Q17R31 274 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 SYT9Q86SS6 491 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC35B4Q969S0 331 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 RFT1Q96AA3 541 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 EPHX3Q9H6B9 360 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 HHATLQ9HCP6 504 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 Q9N2J8 555 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 TBC1D29Q9UFV1 150 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 RASD1Q9Y272 281 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 XKRYO14609 159 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 DSCR3O14972 297 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 TGFBR2P37173 567 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 REEP5Q00765 189 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 RAB40BQ12829 278 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 MAB21L1Q13394 359 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 ATAD3CQ5T2N8 411 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 OR2A1Q8NGT9 310 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 ASB16Q96NS5 453 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXN4Q96NZ1 517 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 A4GALTQ9NPC4 353 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 FKBP7Q9Y680 259 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-211ENST00000503687 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 PRSS38A1L453 326 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 GABRPO00591 440 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 OR2B3O76000 313 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR135Q8IZ08 494 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 YIPF7Q8N8F6 280 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 TM9SF4Q92544 642 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 C4orf36Q96KX1 117 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR174Q9BXC1 333 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 TPSD1Q9BZJ3 242 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 NUDT15Q9NV35 164 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 ANXA2P2A6NMY6 339 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-211ENST00000503687 H3BQ06 376 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms