RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462720.6

PRKCE-204, Transcript of protein kinase C epsilon, human

TSL 5

Gene PRKCE, Length 305 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCE-204	ENST00000462720	POU4F1	Q01851	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	CHRNE	Q04844	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	STX5	Q13190	355 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	OSTF1	Q92882	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	MUCL1	Q96DR8	90 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	WDR34	Q96EX3	536 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	EGFL8	Q99944	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	IFNK	Q9P0W0	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	PHF11	Q9UIL8	331 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720		A0A0A6YYD5	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	AP3B1	O00203	1094 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	FADS1	O60427	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	PCNA	P12004	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	CPM	P14384	443 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	DAO	P14920	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	GGT1	P19440	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	PCMT1	P22061	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	PIK3R1	P27986	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	GCH1	P30793	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	BSG	P35613	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	HSPA7	P48741	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	PHC1	P78364	1004 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	CHIT1	Q13231	466 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	RIN1	Q13671	783 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	MLC1	Q15049	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	ACAP2	Q15057	778 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	LTB4R	Q15722	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720		Q6ZT83	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	MARCH3	Q86UD3	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCE-204	ENST00000462720	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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