RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 AQP1P29972 269 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 LGALS7P47929 136 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CXCL12P48061 93 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 IDH2P48735 452 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2E1P51965 193 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 PUDPQ08623 228 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 VGLL4Q14135 290 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF273Q14593 569 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 NRF1Q16656 503 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM209BQ5JX69 171 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 THEM4Q5T1C6 240 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 LGSNQ5TDP6 509 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAF3Q5VWG9 929 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 AP1ARQ63HQ0 302 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SULT6B1Q6IMI4 303 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 FRMPD2BQ6IN97 320 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFP1Q6P2D0 407 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 LYPD2Q6UXB3 125 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF562Q6V9R5 426 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNM1P46Q6ZS02 220 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 RFLNAQ6ZTI6 216 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOB2Q70IA6 237 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRSS48Q7RTY5 328 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAATS1Q7Z4T9 603 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 BIVMQ86UB2 503 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCA5Q86VQ0 697 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRSS58Q8IYP2 241 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 LFNGQ8NES3 379 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4F5Q8NH21 305 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 DTX3LQ8TDB6 740 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL1F10Q8WWZ1 152 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 LPGAT1Q92604 370 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAD54LQ92698 747 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIMD4Q96H15 378 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 VPS39Q96JC1 886 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 C12orf42Q96LP6 360 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 IP6K3Q96PC2 410 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBCBQ99426 244 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 C19orf43Q9BQ61 176 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf50Q9BV19 199 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACTL8Q9H568 366 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 C12orf10Q9HB07 376 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMC4Q9NTJ3 1288 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRGBPQ9NV56 204 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 MED17Q9NVC6 651 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEPT10Q9P0V9 454 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR1A1Q9P1Q5 309 aa-1.69□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 EML5Q05BV3 1969 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCOR1O75376 2440 aa-1.69□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa-1.7□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 NEMP2A6NFY4 417 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF716A6NP11 495 aa-1.7□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 INS-IGF2F8WCM5 200 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 K7ENP7 123 aa-1.7□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CNMDO75829 334 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGLSO95336 258 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANP32DO95626 131 aa-1.7□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CHRNA1P02708 482 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TK1P04183 234 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF735P0CB33 412 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TDGF1P13385 188 aa-1.7□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ETS2P15036 469 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRLRP16471 622 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 OMGP23515 440 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 GABRA5P31644 462 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP2K4P45985 399 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 FHITP49789 147 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 STK19P49842 368 aaPredicted RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TDGF1P3P51864 188 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASP6P55212 293 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 LIM2P55344 173 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 STARD6P59095 220 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSNK1G2P78368 415 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 VEZF1Q14119 521 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 NFE2L1Q14494 772 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAPK11Q15759 364 aa-1.7□□□□□ -2.68
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