RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CITO14578 2027 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 A6NCN8 305 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 WASH4PA8MWX3 477 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 AKR1C4P17516 323 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 STK19P49842 368 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF136P52737 540 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 INHBCP55103 352 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 NUP43Q8NFH3 380 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MZB1Q8WU39 189 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 C5AR2Q9P296 337 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 GPR45Q9Y5Y3 372 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 PIP5K1CO60331 668 aa8.38□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.38□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 OR6C2Q9NZP2 312 aa8.38□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.38□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 SLC22A5O76082 557 aa8.38□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 GON7Q9BXV9 100 aa8.38□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 SELENOWP63302 87 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MBTPS1Q14703 1052 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 AARDQ4LEZ3 155 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ASPGQ86U10 573 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.38□□□□□ -1.07
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