RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FAM109AQ8N4B1 249 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DPP10Q8N608 796 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF611Q8N823 705 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NAXEQ8NCW5 288 aa4.1□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF678Q5SXM1 525 aa4.1□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 RPTNQ6XPR3 784 aa4.09□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 MDGA2Q7Z553 956 aa4.09□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 STT3AP46977 705 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ART1P52961 327 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJB13P59910 316 aa4.09□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 CDK6Q00534 326 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ITGADQ13349 1161 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MED21Q13503 144 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 UNC50Q53HI1 259 aa4.09□□□□□ -1.75
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