RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 MEIS3P1A6NDR6 274 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 C3P1Q6ZMU1 363 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINA12Q8IW75 414 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 MPIG6BO95866 241 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMB10P40306 273 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEA6P43360 314 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 ESX1Q8N693 406 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 IL17CQ9P0M4 197 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM64BA6NI03 449 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 GABRR3A8MPY1 467 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 FUT1P19526 365 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 CXCR4P61073 352 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL2A1Q16548 175 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 MALSU1Q96EH3 234 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 SSX4O60224 188 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 PNMTP11086 282 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 EPHA1P21709 976 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 CRABP1P29762 137 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR50Q13585 617 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 P2RY14Q15391 338 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR149Q86SP6 731 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 ABHD5Q8WTS1 349 aa22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF254O75437 659 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB3AP20336 220 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 NEIL2Q969S2 332 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 SAMD11Q96NU1 681 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 TREX1Q9NSU2 369 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6C2Q9NZP2 312 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 GCAP28676 217 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM25Q86YD3 366 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 OR56B2PQ8NGI1 322 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PQ09 198 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF43P17038 809 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 HHEXQ03014 270 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 NPRL2Q8WTW4 380 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 NTMT1Q9BV86 223 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC17A9Q9BYT1 436 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 PRDM9Q9NQV7 894 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 IL37Q9NZH6 218 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 KCMF1Q9P0J7 381 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC6A5Q9Y345 797 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BUI4 141 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 GGHQ92820 318 aa22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKACBP22694 351 aa22.77■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TLE3Q04726 772 aa22.77■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 DEFB110Q30KQ9 67 aa22.77■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.77■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 HINT2Q9BX68 163 aa22.77■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 AGPAT2O15120 278 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINA5P05154 406 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM163Q8TC26 289 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 CLMPQ9H6B4 373 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 GIMAP5Q96F15 307 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 C4orf36Q96KX1 117 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 M0QZQ0 153 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 THEGLP0DJG4 465 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS2R20P59543 309 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PSPHP78330 225 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ANTXRLA6NF34 631 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 AGAP6Q5VW22 663 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SCD5Q86SK9 330 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SPTSSAQ969W0 71 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 AGAP4Q96P64 663 aa22.76■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TPT1P13693 172 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ARSBP15848 533 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFSF8P32971 234 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MC2RQ01718 297 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 RASD1Q9Y272 281 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 GIFP27352 417 aa22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms