RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 TOM1O60784 492 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 MX1P20591 662 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 CABP4P57796 275 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRC-210ENST00000462363 COPS6Q7L5N1 327 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 SUCLG2Q96I99 432 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 USP26Q9BXU7 913 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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PTPRC-210ENST00000462363 NUP98P52948 1817 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 SRGAP3O43295 1099 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRC-210ENST00000462363 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRC-210ENST00000462363 BTG4Q9NY30 223 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 USP35Q9P2H5 1018 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 LAMB2P55268 1798 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 MYH3P11055 1940 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 H7C1W4 665 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 SNPHO15079 494 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 CHMLP26374 656 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 BECN1Q14457 450 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 SPEF2Q9C093 1822 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 APBB1O00213 710 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 ERC2O15083 957 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 A1BGP04217 495 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 MYD88Q99836 296 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 EVA1CP58658 441 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 BARGINQ6ZT62 677 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRC-210ENST00000462363 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-210ENST00000462363 NHSQ6T4R5 1651 aa6.93□□□□□ -1.3
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