RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 IL25Q9H293 177 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-201ENST00000060969 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.76■■□□□ 1.23
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SIKE1-201ENST00000060969 C8orf37Q96NL8 207 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-201ENST00000060969 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
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SIKE1-201ENST00000060969 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.73■■□□□ 1.23
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SIKE1-201ENST00000060969 RABEP1Q15276 862 aa22.67■■□□□ 1.22
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SIKE1-201ENST00000060969 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.63■■□□□ 1.21
SIKE1-201ENST00000060969 SIK1P57059 783 aa22.63■■□□□ 1.21
SIKE1-201ENST00000060969 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.63■■□□□ 1.21
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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SIKE1-201ENST00000060969 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SIKE1-201ENST00000060969 EVI5LQ96CN4 794 aa22.61■■□□□ 1.21
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SIKE1-201ENST00000060969 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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SIKE1-201ENST00000060969 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
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SIKE1-201ENST00000060969 RAD50Q92878 1312 aa22.57■■□□□ 1.2
SIKE1-201ENST00000060969 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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SIKE1-201ENST00000060969 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.56■■□□□ 1.2
SIKE1-201ENST00000060969 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.56■■□□□ 1.2
SIKE1-201ENST00000060969 KCNQ4P56696 695 aa22.56■■□□□ 1.2
SIKE1-201ENST00000060969 TIMM10P62072 90 aa22.56■■□□□ 1.2
SIKE1-201ENST00000060969 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.55■■□□□ 1.2
SIKE1-201ENST00000060969 ST18O60284 1047 aa22.55■■□□□ 1.2
SIKE1-201ENST00000060969 ATP5JP18859 108 aa22.55■■□□□ 1.2
SIKE1-201ENST00000060969 HSPA4P34932 840 aa22.55■■□□□ 1.2
SIKE1-201ENST00000060969 CERKQ8TCT0 537 aa22.55■■□□□ 1.2
SIKE1-201ENST00000060969 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.55■■□□□ 1.2
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