RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OR5M10Q6IEU7 315 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CDC73Q6P1J9 531 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ZNF621Q6ZSS3 439 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 MAVSQ7Z434 540 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 C6orf120Q7Z4R8 191 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CLEC4FQ8N1N0 589 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 MIER2Q8N344 545 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ZNF614Q8N883 585 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OR14L1PQ8NHC6 308 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 RELTQ969Z4 430 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 GIMAP5Q96F15 307 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TEX37Q96LM6 180 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OR7D2Q96RA2 312 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 STACQ99469 402 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 EBF4Q9BQW3 602 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SLC35A5Q9BS91 424 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 BTBD2Q9BX70 525 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 PTGES2Q9H7Z7 377 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 RMND5AQ9H871 391 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 NPHS2Q9NP85 383 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 MED4Q9NPJ6 270 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SERHLQ9NQF3 203 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 GIN1Q9NXP7 522 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 NTMQ9P121 344 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 DUXAA6NLW8 204 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 SCDO00767 359 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ZNF195O14628 629 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 NDUFB5O43674 189 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ZG16O60844 167 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 IL6P05231 212 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 HPNP05981 417 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 PTPN6P29350 595 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 IL12AP29459 219 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 PTGDSP41222 190 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 KHKP50053 298 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CASP9P55211 416 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 WNT3P56703 355 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 HPCAP84074 193 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 GXYLT1Q4G148 440 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 DCST2Q5T1A1 773 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 C16orf62Q7Z3J2 963 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 MARCH3Q86UD3 253 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CDH24Q86UP0 819 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 IFNEQ86WN2 208 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 WDSUB1Q8N9V3 476 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 GATSQ8NAP1 163 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ZNF527Q8NB42 609 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OR5D16Q8NGK9 328 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CCDC120Q96HB5 630 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 CCDC28BQ9BUN5 200 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 OR51I1Q9H343 314 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 DSN1Q9H410 356 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 PIGUQ9H490 435 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 HHATLQ9HCP6 504 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 DUSP22Q9NRW4 184 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 EXD2Q9NVH0 621 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 MED11Q9P086 117 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 BTNL2Q9UIR0 455 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.09□□□□□ -1.27
SMG6-211ENST00000572369 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.09□□□□□ -1.27
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