RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 BORAQ6PGQ7 559 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 ZAR1Q86SH2 424 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 CMIPQ8IY22 773 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 BCORP1Q8N888 145 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 RHOXF1Q8NHV9 184 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 STT3BQ8TCJ2 826 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 SLC2A12Q8TD20 617 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 CLIP3Q96DZ5 547 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 NUDT9Q9BW91 350 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 PRR14Q9BWN1 585 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 ITPAQ9BY32 194 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 C14orf105Q9NVL8 296 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 DTX4Q9Y2E6 619 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 TRAPPC13A5PLN9 417 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 FRG2CA6NGY1 282 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 CLDN24A6NM45 220 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 OR6C76A6NM76 312 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 ZAR1LA6NP61 321 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 EFCAB7A8K855 629 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 A8MUA0 341 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 NPIPA7E9PJI5 369 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 TO15178 435 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 MPZL2O60487 215 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 LYPD3O95274 346 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 TIAF1O95411 115 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 IL33O95760 270 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 THY1P04216 161 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 ZGLP1P0C6A0 271 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 NPIPA8P0DM63 369 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 POU2F1P14859 743 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 CHMP24386 653 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 ADH7P40394 386 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 GPR143P51810 404 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 PSPHP78330 225 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 FGFBP1Q14512 234 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 NADK2Q4G0N4 442 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 BROXQ5VW32 411 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 ZNF773Q6PK81 442 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 BMPERQ8N8U9 685 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 OR1N1Q8NGS0 311 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 ADIPOR1Q96A54 375 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 LRFN5Q96NI6 719 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 ZNF559Q9BR84 538 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 OR8D2Q9GZM6 311 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 SLC26A1Q9H2B4 701 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 DUSP21Q9H596 190 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 SCN3BQ9NY72 215 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 RNF6Q9Y252 685 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 OR10H1Q9Y4A9 318 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 CACNA1EQ15878 2313 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-209ENST00000547449 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-209ENST00000547449 SERINC4A6NH21 518 aa9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms