RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	TMED2	Q15363	201 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PSMD5	Q16401	504 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF74	Q16587	644 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	NSMAF	Q92636	917 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	GBA3	Q9H227	469 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PTPRD	P23468	1912 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	NUP205	Q92621	2012 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	DFFA	O00273	331 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF195	O14628	629 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	TM9SF1	O15321	606 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	TEX28	O15482	410 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	COCH	O43405	550 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ACSL4	O60488	711 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	UGT1A9	O60656	530 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SPAG7	O75391	227 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ANXA9	O76027	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	GJB5	O95377	273 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	HSPA4L	O95757	839 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PGAM1	P18669	254 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	HLA-F	P30511	346 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SERPINB9	P50453	376 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	NAGLU	P54802	743 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CRADD	P78560	199 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	DEFB103A	P81534	67 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	IL9R	Q01113	521 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	IL10RB	Q08334	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	NAB1	Q13506	487 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	IHH	Q14623	411 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	MARC1	Q5VT66	337 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	LINC00523	Q86TU6	105 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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