RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 COL6A2P12110 1019 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 HSD17B3P37058 310 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT6CP48668 564 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 PRR5P85299 388 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 GALNT18Q6P9A2 607 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 APOOLQ6UXV4 268 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 DNM1P46Q6ZS02 220 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM151AQ8N4L1 468 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 CDYL2Q8N8U2 506 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 STEAP2Q8NFT2 490 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 FBXW5Q969U6 566 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 APIPQ96GX9 242 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ACPTQ9BZG2 426 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 RAB17Q9H0T7 212 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 Q9N2J8 555 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 NFU1Q9UMS0 254 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 LIPT1Q9Y234 373 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF115Q9Y4L5 304 aa13.32□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 A8MT66 165 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 UPK1AO00322 258 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 CXCL13O43927 109 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ULK1O75385 1050 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 UTS2O95399 124 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 SYNGR4O95473 234 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 SBK3P0C264 359 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF17P17021 662 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 DDCP20711 480 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ACVR1BP36896 505 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 CLCQ05315 142 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ACSM2AQ08AH3 577 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 C2orf54Q08AI8 447 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 RASA2Q15283 850 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 PRSS53Q2L4Q9 553 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 SPIN4Q56A73 249 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 NCMAPQ5T1S8 102 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ACSM2BQ68CK6 577 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ALKBH2Q6NS38 261 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 MFSD12Q6NUT3 480 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 GALNT10Q86SR1 603 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 EXOC3L1Q86VI1 746 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 OR2L13Q8N349 312 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 S100PBPQ96BU1 408 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 HDHD5Q9BXW7 423 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ACSS3Q9H6R3 686 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 TAS2R7Q9NYW3 318 aa13.31□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A087WZY1 265 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 CLOCKO15516 846 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 GMFGO60234 142 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 IGHV4-39P01824 125 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 JUNP05412 331 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 TUBBP07437 444 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 CD3EP07766 207 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 PHBP35232 272 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 CDKN1AP38936 164 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 GSTM5P46439 218 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 RFX3P48380 749 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 RAC1P63000 192 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 CHRFAM7AQ494W8 412 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM107Q6UX40 140 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 GABRG1Q8N1C3 465 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 OR2V1Q8NHB1 315 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 METTL6Q8TCB7 284 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 NGBQ9NPG2 151 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 SIRT5Q9NXA8 310 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 VDAC3Q9Y277 283 aa13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A0J9YW62 118 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 C7orf72A4D263 438 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 A8MV72 311 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ALG1L2C9J202 215 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ADAM11O75078 769 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 NDUFS7O75251 213 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 F12P00748 615 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 OPN1LWP04000 364 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 ADH6P28332 368 aa13.29□□□□□ -0.28
ACTBP11-201ENST00000436287 AGTR1P30556 359 aa13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms