RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590220.1

PIK3C3-213, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, human

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 168 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3C3-213	ENST00000590220	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	OR51F2	Q8NH61	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	DSN1	Q9H410	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	MOK	Q9UQ07	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220		A0A1W2PR48	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220		A0A1W2PS29	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	C7orf72	A4D263	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	CTAGE9	A4FU28	777 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220		E7EVH7	732 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	CXCL13	O43927	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	FADS1	O60427	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	EED	O75530	441 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	HAUS5	O94927	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SYNGR4	O95473	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	NTN1	O95631	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	GUCA1C	O95843	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	KNG1	P01042	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	APRT	P07741	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	IFNGR1	P15260	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	GGT5	P36269	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SERPINF1	P36955	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	EMD	P50402	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	LMO4	P61968	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	RAC1	P63000	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	CCNI	Q14094	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	STK11	Q15831	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	NNAT	Q16517	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	TMBIM1	Q969X1	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	MUS81	Q96NY9	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	GPA33	Q99795	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	MED11	Q9P086	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220		A0A0A6YYD5	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220		A0A0J9YW62	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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