RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 NPIPA7E9PJI5 369 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 UGT2B17O75795 530 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJB5O75953 348 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 NPIPA8P0DM63 369 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 NRF1Q16656 503 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF605Q86T29 641 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 SVOPLQ8N434 492 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 LMF1Q96S06 567 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 WWTR1Q9GZV5 400 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 U3KQV3 271 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 J3KTA2 159 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 M0R3H8 397 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 DBIP07108 87 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 YAP1P46937 504 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 DCAF7P61962 342 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 FLYWCH1Q4VC44 716 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 TCTN3Q6NUS6 607 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF836Q6ZNA1 936 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 CLIP4Q8N3C7 705 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF441Q8N8Z8 693 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 OR5K1Q8NHB7 308 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 LPAR4Q99677 370 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGDIGQ99819 225 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 G6PC3Q9BUM1 346 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 VCXQ9H320 206 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 CEP250Q9BV73 2442 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 CLDN24A6NM45 220 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 G3V2T6 193 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 H0YJX3 145 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 EI24O14681 340 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 CCNYL3P0C7X3 344 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 IL7RP16871 459 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 RHCEP18577 417 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 RFX3P48380 749 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 TMPRSS12Q86WS5 348 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 HS3ST5Q8IZT8 346 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 GAL3ST4Q96RP7 486 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 C7orf72A4D263 438 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 NPIPB9F8W1W9 429 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 FFAR1O14842 300 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 E2F6O75461 281 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 CEACAM1P13688 526 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 NID1P14543 1247 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 RRM2P31350 389 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC29A4Q7RTT9 530 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 OR6T1Q8NGN1 323 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 CT55Q8WUE5 264 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF597Q96LX8 424 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 PIP5K1AQ99755 562 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 NRSN2Q9GZP1 204 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 REEP1Q9H902 201 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 C8orf4Q9NR00 106 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 RLIMQ9NVW2 624 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 KCND3Q9UK17 655 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF232Q9UNY5 417 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 TESMINQ9Y4I5 508 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 ADAMDEC1O15204 470 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 CD63P08962 238 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 RAB40ALP0C0E4 278 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP6V1C1P21283 382 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 NPTX1Q15818 432 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 LIN52Q52LA3 116 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 STK32CQ86UX6 486 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 C17orf47Q8NEP4 570 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 B3GNT4Q9C0J1 378 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 ACAD8Q9UKU7 415 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 DLGAP1O14490 977 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 TO15178 435 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 TNFSF15O95150 251 aa24.03■■□□□ 1.44
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SCAMP4-210ENST00000588555 FUT4P22083 530 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC26A5P58743 744 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF4P78317 190 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 NHLH1Q02575 133 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 PCOLCEQ15113 449 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF220Q5VTB9 566 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 VMP1Q96GC9 406 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 EPYCQ99645 322 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 TCN2P20062 427 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 FOLR3P41439 243 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-210ENST00000588555 PLAURQ03405 335 aa24.03■■□□□ 1.44
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