RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541134.5

HIVEP1-208, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HIVEP1, Length 9,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-208ENST00000541134 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 ATG5Q9H1Y0 275 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 C8orf4Q9NR00 106 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 SPHK1Q9NYA1 384 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 RIMS3Q9UJD0 308 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 EFR3AQ14156 821 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 SSX6Q7RTT6 188 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 ZUFSPQ96AP4 578 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 PLEK2Q9NYT0 353 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 TAF4O00268 1085 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 PRAMEF10O60809 474 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 CHRM4P08173 479 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 FXYD6P3P58550 94 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa11.13□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 TRAPPC13A5PLN9 417 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 BCL6P41182 706 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 CDKL1Q00532 357 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 LIPKQ5VXJ0 399 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 KDM1BQ8NB78 822 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 HS6ST2Q96MM7 605 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 GABRG2P18507 467 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 VAMP1P23763 118 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 CDKN2CP42773 168 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 FAM117AQ9C073 453 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 LRRN3Q9H3W5 708 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 KCND3Q9UK17 655 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 F13BP05160 661 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 PNMTP11086 282 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 PSKH1P11801 424 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 KCTD9Q7L273 389 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 ARSGQ96EG1 525 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 CTSLP07711 333 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 RAB38P57729 211 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 RELL1Q8IUW5 271 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 OR4K5Q8NGD3 323 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 NXPE2Q96DL1 559 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 C1GALT1Q9NS00 363 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 TAS2R10Q9NYW0 307 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 KLHL13Q9P2N7 655 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 STRCQ7RTU9 1775 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 L7N2F9 121 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 RRADP55042 308 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 VAMP2P63027 116 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 LRR1Q96L50 414 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 HINT2Q9BX68 163 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 J3KTA2 159 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 CEACAM7Q14002 265 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 PYCR3Q53H96 274 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 HPS1Q92902 700 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 ZNF442Q9H7R0 627 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 SSC5DA1L4H1 1573 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 OR2W5A6NFC9 320 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 TMEM225BP0DP42 221 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 GNRHRP30968 328 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 GFERP55789 205 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 CCDC74BQ96LY2 380 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 MUS81Q96NY9 551 aa11.12□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 ALOX12BO75342 701 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 SLC2A5P22732 501 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 HERV-K104P61576 105 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 CLEC14AQ86T13 490 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 ITPAQ9BY32 194 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 WASF3Q9UPY6 502 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 A0A1W2PPC4 97 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 FTCDNL1E5RQL4 147 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 MAGEA8P43361 318 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 S100A10P60903 97 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 LTC4SQ16873 150 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 FAM205BPQ63HN1 556 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 ZNF615Q8N8J6 731 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 TLCD2A6NGC4 264 aa11.11□□□□□ -0.63
HIVEP1-208ENST00000541134 MPLP40238 635 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms