RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	MYNN	Q9NPC7	610 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	GLTPD2	A6NH11	291 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	FAM183A	A6NL82	134 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SLC31A1	O15431	190 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	GMDS	O60547	372 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	MAS1	P04201	325 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CXCR1	P25024	350 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	BTG1	P62324	171 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ID2	Q02363	134 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	OCLN	Q16625	522 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CDNF	Q49AH0	187 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TCTE1	Q5JU00	501 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SPRYD7	Q5W111	196 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	HBM	Q6B0K9	141 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ABHD13	Q7L211	337 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	OR4K13	Q8NH42	304 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ASB11	Q8WXH4	323 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	FZD9	O00144	591 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PRKCA	P17252	672 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	NUDT1	P36639	197 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TPMT	P51580	245 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27	4e-9	■■■■■ 36.1
PKD1-222	ENST00000496574	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TP53I3	Q53FA7	332 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	APCDD1	Q8J025	514 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CSF3R	Q99062	836 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	UBXN7	O94888	489 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TM9SF4	Q92544	642 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ELP4	Q96EB1	424 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	DPH1	Q9BZG8	443 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ADH6	P28332	368 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	GRPR	P30550	384 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	AHR	P35869	848 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SLC19A1	P41440	591 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	LALBA	P00709	142 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	S100A12	P80511	92 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF550	Q7Z398	422 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CPA6	Q8N4T0	437 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	FAM227A	F5H4B4	570 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SFTPB	P07988	381 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TYR	P14679	529 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	EPHA2	P29317	976 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	AKT2	P31751	481 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	MRI1	Q9BV20	369 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	FN3K	Q9H479	309 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ASIC5	Q9NY37	505 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	FEZF1	A0PJY2	475 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PPM1B	O75688	479 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	KCNK2	O95069	426 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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