RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477234.1

SBF1-208, Transcript of SET binding factor 1, human

TSL 5

Gene SBF1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF1-208	ENST00000477234	FBXO45	P0C2W1	286 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	IDO1	P14902	403 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	PPP2R1B	P30154	601 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	GSTM5	P46439	218 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	NEK2	P51955	445 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	RAP1GDS1	P52306	607 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	WNT3	P56703	355 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	EMX2	Q04743	252 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	NTRK2	Q16620	822 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	GSTA3	Q16772	222 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	BEX5	Q5H9J7	111 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	MAVS	Q7Z434	540 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	EBF4	Q9BQW3	602 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	ACPT	Q9BZG2	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	UBQLN3	Q9H347	655 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	HEY2	Q9UBP5	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	DAPP1	Q9UN19	280 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	OR6C76	A6NM76	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234		E9PBE3	544 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	WIPF1	O43516	503 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	PEX11A	O75192	247 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	PRPS2	P11908	318 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	POU2F1	P14859	743 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	ATP4B	P51164	291 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	NRG3	P56975	720 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	RUNX2	Q13950	521 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	RPS6KA2	Q15349	733 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	GALNTL6	Q49A17	601 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	LIPN	Q5VXI9	398 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234		Q6ZSR9	355 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF611	Q8N823	705 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	FAM47B	Q8NA70	645 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF721	Q8TF20	911 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	RGMA	Q96B86	450 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	C3orf30	Q96M34	536 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	MS4A8	Q9BY19	250 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	LYRM4	Q9HD34	91 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	ASIC5	Q9NY37	505 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SBF1-208	ENST00000477234	LRIT2	A6NDA9	550 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	EBAG9	O00559	213 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	CYR61	O00622	381 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	TGFB1	P01137	390 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	FES	P07332	822 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	UGT2B10	P36537	528 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	ASMT	P46597	345 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	KCNJ5	P48544	419 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	LIM2	P55344	173 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	PLIN5	Q00G26	463 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	HMGCS1	Q01581	520 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63	4e-6	■■■■□ 22.2
SBF1-208	ENST00000477234	SQLE	Q14534	574 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	AAGAB	Q6PD74	315 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	DGAT2	Q96PD7	388 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	KCNC2	Q96PR1	638 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	OR52B2	Q96RD2	323 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SBF1-208	ENST00000477234	HBEGF	Q99075	208 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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