RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ART5Q96L15 291 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 G6PC3Q9BUM1 346 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10A5Q9H207 317 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 EVA1AQ9H8M9 152 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 Q9N2J8 555 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ACER3Q9NUN7 267 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM118AQ9NWS6 357 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 MKLN1Q9UL63 735 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 R4GN57 208 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 AGAP5A6NIR3 686 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CCNB2O95067 398 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 H1F0P07305 194 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF806P0C7X5 589 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 AGXTP21549 392 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ACP1P24666 158 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SSTR4P31391 388 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 RORAP35398 523 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DAPP51397 102 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 E2F1Q01094 437 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 IL1RL1Q01638 556 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR68Q15743 365 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSWIM7Q19AV6 140 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 VWA2Q5GFL6 755 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DCST1Q5T197 706 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FRRS1Q6ZNA5 592 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TCEAL3Q969E4 200 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZG16BQ96DA0 208 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF350Q9GZX5 532 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TOR3AQ9H497 397 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FOLH1BQ9HBA9 442 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT84Q9NSB2 600 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 VNN3Q9NY84 501 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10H1Q9Y4A9 318 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ASXL3Q9C0F0 2248 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DSPPQ9NZW4 1301 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC16AO15027 2179 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PRQ8 180 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2W5A6NFC9 320 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 EFCAB7A8K855 629 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 J3KTA2 159 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC16A6O15403 523 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 BRINP1O60477 761 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNK2O95069 426 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF5P12034 268 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DCAF7P61962 342 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PSG6Q00889 435 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 IL18R1Q13478 541 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DGCR6Q14129 220 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 LIN52Q52LA3 116 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FAHD1Q6P587 224 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF605Q86T29 641 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 VRK2Q86Y07 508 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10G2Q8NGC3 310 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms