RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.2□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 CACNG6Q9BXT2 260 aa5.2□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.2□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 MAGIXQ9H6Y5 334 aa5.2□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 TRPV4Q9HBA0 871 aa5.2□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5.2□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 TMEM5Q9Y2B1 443 aa5.2□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 LINC01553A4QN01 128 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 TRAPPC13A5PLN9 417 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 FAM221BA6H8Z2 402 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 OR2W5A6NFC9 320 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 PDCD5O14737 125 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 PRH1P02810 166 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 F13BP05160 661 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 YES1P07947 543 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 JMJD7P0C870 316 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 FUT1P19526 365 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 S100A1P23297 94 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 CHMP24386 653 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 PCGF2P35227 344 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 KCNJ5P48544 419 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 PPP5CP53041 499 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 PFN3P60673 137 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 PLGLB1Q02325 96 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 MAB21L1Q13394 359 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 CDKN3Q16667 212 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 QSOX2Q6ZRP7 698 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 GALNT7Q86SF2 657 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 SERPINA11Q86U17 422 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 C12orf40Q86WS4 652 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 GOLM1Q8NBJ4 401 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 DENND6BQ8NEG7 585 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 THAP4Q8WY91 577 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 MROQ9BYG7 248 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 CST11Q9H112 138 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 GORASP2Q9H8Y8 452 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 MCCC2Q9HCC0 563 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 OR2S2Q9NQN1 319 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 PRODH2Q9UF12 536 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 ZNF639Q9UID6 485 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 POU2F3Q9UKI9 436 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 TRIP11Q15643 1979 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 H0YGG7 62 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 H0YJX3 145 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 GFRA2O00451 464 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 AIFM1O95831 613 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 C7P10643 843 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 LIPCP11150 499 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 EPHA2P29317 976 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 GGT2P36268 569 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 DEFA5Q01523 94 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 ZNF91Q05481 1191 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 PRKCDQ05655 676 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 SLC14A2Q15849 920 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 LHX8Q68G74 356 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 NIPAL1Q6NVV3 410 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 CCDC80Q76M96 950 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 PELI3Q8N2H9 469 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 METTL25Q8N6Q8 603 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 OR2L8Q8NGY9 312 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 CCL4L1Q8NHW4 92 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 RFT1Q96AA3 541 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 TOX2Q96NM4 488 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-201ENST00000261169 OR5M11Q96RB7 305 aa5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms