RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 HSD17B7P56937 341 aa10.65□□□□□ -0.7
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CAPNS1-209ENST00000590049 SERTAD2Q14140 314 aa10.65□□□□□ -0.7
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CAPNS1-209ENST00000590049 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
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CAPNS1-209ENST00000590049 SLC2A7Q6PXP3 512 aa10.64□□□□□ -0.71
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CAPNS1-209ENST00000590049 OVCH1Q7RTY7 1134 aa10.64□□□□□ -0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 SZRD1Q7Z422 152 aa10.64□□□□□ -0.71
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CAPNS1-209ENST00000590049 TGIF2Q9GZN2 237 aa10.63□□□□□ -0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 C1orf21Q9H246 121 aa10.63□□□□□ -0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR54Q9H977 334 aa10.63□□□□□ -0.71
CAPNS1-209ENST00000590049 C3orf14Q9HBI5 128 aa10.63□□□□□ -0.71
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