RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 PAX5Q02548 391 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 CSRP2Q16527 193 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF568Q3ZCX4 644 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMARCE1-208ENST00000474246 PIGGQ5H8A4 983 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMARCE1-208ENST00000474246 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 TEX26Q8N6G2 289 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 PDPRQ8NCN5 879 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMARCE1-208ENST00000474246 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMARCE1-208ENST00000474246 IFT27Q9BW83 186 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMARCE1-208ENST00000474246 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 FBXL3Q9UKT7 428 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMARCE1-208ENST00000474246 A0A087X1B8 175 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 A0A1W2PNV4 684 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 J3KTA2 159 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 KCNK3O14649 394 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMARCE1-208ENST00000474246 TGFB1P01137 390 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 IFNGP01579 166 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMARCE1-208ENST00000474246 CCR7P32248 378 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 PCK1P35558 622 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ID1P41134 155 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 MTNR1AP48039 350 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 NDUFV1P49821 464 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 HERV-K104P63124 156 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMARCE1-208ENST00000474246 RBBP4Q09028 425 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 RUNX2Q13950 521 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 DPYSL3Q14195 570 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ZBTB6Q15916 424 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF699Q32M78 642 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 C17orf107Q6ZR85 190 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 RRM2BQ7LG56 351 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 PIGWQ7Z7B1 504 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 LACC1Q8IV20 430 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 SORCS1Q8WY21 1168 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 NRGNQ92686 78 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 UFD1Q92890 307 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 SMARCD2Q92925 531 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ACDQ96AP0 544 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ELMOD3Q96FG2 381 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 C16orf92Q96LL3 132 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 PWWP2AQ96N64 755 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 PFDN5Q99471 154 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF559Q9BR84 538 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 MYL10Q9BUA6 226 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ADI1Q9BV57 179 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 SIRPDQ9H106 197 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 NANSQ9NR45 359 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 CHST7Q9NS84 486 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 MMP24Q9Y5R2 645 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 A0A1B0GVM2 712 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM233B4DJY2 109 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 NDUFS4O43181 175 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 SGCEO43556 437 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 SNAI2O43623 268 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 LIASO43766 372 aa5.68□□□□□ -1.5
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