RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRIN2DO15399 1336 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC17A2O00624 439 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TM9SF1O15321 606 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPIHO43447 177 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKR7A3O95154 331 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC2A10O95528 541 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 FUT1P19526 365 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJB1P25685 340 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL2RGP31785 369 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 MDH2P40926 338 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 XCR1P46094 333 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALDH3B2P48448 385 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 OSTNP61366 133 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKCEQ02156 737 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSF2Q03933 536 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD47Q08722 323 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL18R1Q13478 541 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SERTAD2Q14140 314 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TFDP1Q14186 410 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 UTF1Q5T230 341 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 C12orf60Q5U649 245 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 OLFML2AQ68BL7 652 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CGB2Q6NT52 195 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC39A4Q6P5W5 647 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARSKQ6UWY0 536 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTNL3Q6UXE8 466 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q7L0L9 218 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXL16Q8N461 479 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF525Q8N782 197 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 GIPC3Q8TF64 312 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SELENOMQ8WWX9 145 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADIPOR1Q96A54 375 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 UPRTQ96BW1 309 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCT8L2Q96SF2 557 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TM2D1Q9BX74 207 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFKBIZQ9BYH8 718 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELOVL4Q9GZR5 314 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIEF1Q9NQG6 463 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNFRSF19Q9NS68 423 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR34Q9NV39 138 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPM3Q9P2X0 92 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXJ3Q9UPW0 622 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0U1RQV5 110 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 WASHC1A8K0Z3 465 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 WASH3PC4AMC7 463 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CASKO14936 926 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAMP1O60894 148 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSC22D2O75157 780 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS26AO75436 327 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCGB2A1O75556 95 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM16O95361 564 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 JCHAINP01591 159 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 THRBP10828 461 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANXA3P12429 323 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 UQCRBP14927 111 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLK2P20151 261 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAICSP22234 425 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 FASP25445 335 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKAR2BP31323 418 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAPAP54920 295 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 BPIFB3P59826 476 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPYSQ14117 519 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 INAQ16352 499 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAMK4Q16566 473 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADPRMQ3LIE5 342 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT71Q3SY84 523 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCYL2Q6P3W7 929 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAMR1Q6UXH9 720 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNC5DQ6UXZ4 953 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 WASH2PQ6VEQ5 465 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSCAN30Q86W11 494 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF584Q8IVC4 421 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 STKLD1Q8NE28 680 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR52B4Q8NGK2 314 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC26Q8TAB7 109 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC110Q8TBZ0 833 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 VSTM2LQ96N03 204 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS35Q96QK1 796 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBCDQ9BTW9 1192 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAXXQ9BUH6 204 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 FICDQ9BVA6 458 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 DEFB126Q9BYW3 111 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 LPAR2Q9HBW0 351 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms