RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-217	ENST00000583667	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OR7G2	Q8NG99	324 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	LZIC	Q8WZA0	190 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	NDC1	Q9BTX1	674 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	VCX	Q9H320	206 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OR51I1	Q9H343	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CALML5	Q9NZT1	146 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	KLHL3	Q9UH77	587 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ESPL1	Q14674	2120 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TTC36	A6NLP5	189 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	EFCAB7	A8K855	629 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	C5orf58	C9J3I9	102 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MFN2	O95140	757 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	S1PR1	P21453	382 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MC3R	P41968	323 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	KCNJ10	P78508	379 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	KCNAB1	Q14722	419 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SVOPL	Q8N434	492 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	BBS10	Q8TAM1	723 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	FAM110B	Q8TC76	370 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	EME1	Q96AY2	570 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TAMM41	Q96BW9	452 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM19	Q96HH6	336 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF597	Q96LX8	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF607	Q96SK3	696 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	BTBD2	Q9BX70	525 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PIGU	Q9H490	435 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SDK2	Q58EX2	2172 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667		A0A1B0GX78	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	LDB3	O75112	727 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SERPINB7	O75635	380 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	RASAL1	O95294	804 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	HBQ1	P09105	142 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OR12D1	P0DN82	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	FGF5	P12034	268 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	STT3A	P46977	705 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CRISP3	P54108	245 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	IL11RA	Q14626	422 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TAF11	Q15544	211 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	LTB4R	Q15722	352 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	KAT2A	Q92830	837 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	RAB8B	Q92930	207 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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