RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PNLIPRP2P54317 469 aa30.44■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPP38P78345 283 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAXO2Q658L1 398 aa30.44■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC2A7Q6PXP3 512 aa30.44■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 GK5Q6ZS86 529 aa30.44■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS15Q8TE58 950 aa30.44■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PIK3R3Q92569 461 aa30.44■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35G5Q96KT7 338 aa30.44■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 UGT2B11O75310 529 aa30.43■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXW8Q8N3Y1 598 aa30.43■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ASPDHA6ND91 283 aa30.42■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHF12Q96QT6 1004 aa30.42■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PEX1O43933 1283 aa30.42■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa30.42■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TAAR6Q96RI8 345 aa30.42■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC6A13Q9NSD5 602 aa30.42■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEPPQ9NTK1 212 aa30.42■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAM21Q9UKJ8 722 aa30.42■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IL33O95760 270 aa30.41■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMCO6Q96DC7 493 aa30.41■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR7D2Q96RA2 312 aa30.41■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KLF10Q13118 480 aa30.4■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2M7Q8NG81 312 aa30.39■■■□□ 2.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 G3V3Y1 287 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANGPT2O15123 496 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT75O95678 551 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CASP3P42574 277 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMP22Q01453 160 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRIF1Q5T3J3 769 aa30.38■■■□□ 2.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGWQ7Z7B1 504 aa30.38■■■□□ 2.45
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