RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515952.1

RNU6-138P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 138, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-138P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-138P-201ENST00000515952 MEF2DQ14814 521 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 PSMD6Q15008 389 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 IRF4Q15306 451 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 MEDAGQ5VYS4 303 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 NANOGP8Q6NSW7 305 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 ITIH5Q86UX2 942 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 LUZP1Q86V48 1076 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 C12orf56Q8IXR9 622 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 OR9A1PQ8NGU1 263 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 RAET1EQ8TD07 263 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 LRRC58Q96CX6 371 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 CAPNS2Q96L46 248 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 ZNF558Q96NG5 402 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 OR2M2Q96R28 347 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 GPR174Q9BXC1 333 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 MINDY3Q9H8M7 445 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 SLC25A19Q9HC21 320 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 ITM2BQ9Y287 266 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 AFF2P51816 1311 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 COL24A1Q17RW2 1714 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 POLQO75417 2590 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 A0A0A6YYD4 124 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 YJEFN3A6XGL0 299 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 TSPAN2O60636 221 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 TADA2AO75478 443 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 OAS1P00973 400 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 IGHV3-48P01763 117 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 CSF2P04141 144 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 GHRP10912 638 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 TCF4P15884 667 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 MC5RP33032 325 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 BTDP43251 543 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 NSFP46459 744 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 VCPP55072 806 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 LRP2P98164 4655 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 ZNF85Q03923 595 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 KLHL30Q0D2K2 578 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 SLC39A6Q13433 755 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 ALCAMQ13740 583 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 LRRC36Q1X8D7 754 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 CMPK2Q5EBM0 449 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 DDI2Q5TDH0 399 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 Q6ZR03 302 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 CHST3Q7LGC8 479 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 SYT14Q8NB59 555 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 TRPV3Q8NET8 790 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 HAVCR1Q96D42 359 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 TXN2Q99757 166 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 KLHL4Q9C0H6 718 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 SH2D2AQ9NP31 389 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 PIGVQ9NUD9 493 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 GDAP2Q9NXN4 497 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 TGP01266 2768 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 LRP4O75096 1905 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 SZT2Q5T011 3432 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 CACNA1HO95180 2353 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 SPEGQ15772 3267 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 FAM208BQ5VWN6 2430 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 CEP350Q5VT06 3117 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 SCN2AQ99250 2005 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 ITPR1Q14643 2758 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 UNC80Q8N2C7 3258 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 MGAM2Q2M2H8 2515 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 A0A1B0GW55 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 A6NCN8 305 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 TUBAL3A6NHL2 446 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 ANKDD1BA6NHY2 528 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 PDE5AO76074 875 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 DUX4L2P0CJ85 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 DUX4L3P0CJ86 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 DUX4L5P0CJ88 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 DUX4L6P0CJ89 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 DUX4L7P0CJ90 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 ALOX12P18054 663 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 PSMA3P25788 255 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 RAB28P51157 221 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 NSDHLQ15738 373 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 FAM219AQ8IW50 185 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-138P-201ENST00000515952 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms