RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489772.5

GGA1-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1, human

TSL 2

Gene GGA1, Length 1,384 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA1-222	ENST00000489772	DESI1	Q6ICB0	168 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	SZRD1	Q7Z422	152 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	GNRHR2	Q96P88	292 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	NUF2	Q9BZD4	464 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	PNPO	Q9NVS9	261 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	ASIC5	Q9NY37	505 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	CBLC	Q9ULV8	474 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772		A0A1W2PRB8	838 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	C2orf72	A6NCS6	295 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	GNB5	O14775	395 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	EMC8	O43402	210 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	TSPAN2	O60636	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	KCNH1	O95259	989 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	AGA	P20933	346 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	GABRA3	P34903	492 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	CLDN8	P56748	225 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	C21orf58	P58505	322 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	GAB1	Q13480	694 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	TOMM20	Q15388	145 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	WLS	Q5T9L3	541 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	XKRX	Q6PP77	449 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	HDX	Q7Z353	690 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	NUP43	Q8NFH3	380 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	UBQLN3	Q9H347	655 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	EQTN	Q9NQ60	294 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	NTM	Q9P121	344 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	ADAM10	O14672	748 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	CBR3	O75828	277 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	HPN	P05981	417 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	LBP	P18428	481 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	PTPN6	P29350	595 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	GCK	P35557	465 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	PTGDS	P41222	190 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	TRPC1	P48995	793 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	ART3	Q13508	389 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	GPR151	Q8TDV0	419 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	ARL8A	Q96BM9	186 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	NTNG2	Q96CW9	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	COQ8B	Q96D53	544 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	DUSP26	Q9BV47	211 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA1-222	ENST00000489772	PRSS44	E7EML9	344 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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