RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 IMPA1P29218 277 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 LCN1P31025 176 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 DGKGP49619 791 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CCR6P51684 374 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 MESP2Q0VG99 397 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CAMK2DQ13557 499 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TPBGQ13641 420 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SYTL3Q4VX76 610 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TMEM201Q5SNT2 666 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 IER5LQ5T953 404 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 MTFR2Q6P444 385 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 OXR1Q8N573 874 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 OR10Z1Q8NGY1 313 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 COQ8AQ8NI60 647 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 FERD3LQ96RJ6 166 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PRR14Q9BWN1 585 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CFHR5Q9BXR6 569 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 STK25O00506 426 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GABRPO00591 440 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 MOSPD3O75425 235 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SLCO2B1O94956 709 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CD3GP09693 182 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CCL5P13501 91 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 VIPR1P32241 457 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 IRS1P35568 1242 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 AP1S2P56377 157 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 C3orf38Q5JPI3 329 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 C12orf73Q69YU5 71 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 LYPD4Q6UWN0 246 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PLA2G15Q8NCC3 412 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 IRF7Q92985 503 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SCMH1Q96GD3 660 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 NRTNQ99748 197 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 OR6C2Q9NZP2 312 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GULP1Q9UBP9 304 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 MYO10Q9HD67 2058 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PLXNA2O75051 1894 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GPR171O14626 319 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SLC19A2O60779 497 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 LALBAP00709 142 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GNRH1P01148 92 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 BCHEP06276 602 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 MTNR1AP48039 350 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GIPRP48546 466 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ERVFC1P60507 584 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 DSTNP60981 165 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SP140Q13342 867 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 OCLNQ16625 522 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CRB2Q5IJ48 1285 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CD276Q5ZPR3 534 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GPR135Q8IZ08 494 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 OR7G3Q8NG95 312 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 OR8D4Q8NGM9 314 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 NEIL2Q969S2 332 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 FCRL1Q96LA6 429 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 MRGPRX3Q96LB0 322 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 DSPPQ9NZW4 1301 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ANKDD1BA6NHY2 528 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 DVL2O14641 736 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 NPC1O15118 1278 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 RPS7P62081 194 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ZNF273Q14593 569 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TOMM5Q8N4H5 51 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SLC7A13Q8TCU3 470 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 RAB8BQ92930 207 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PPCDCQ96CD2 204 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SPHK2Q9NRA0 654 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SZT2Q5T011 3432 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 K7ESM1 405 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 HRO43593 1189 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CH25HO95992 272 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 OR12D1P0DN82 309 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PCSK2P16519 638 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 RPS13P62277 151 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 LIPJQ5W064 366 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TCTN3Q6NUS6 607 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PGBD2Q6P3X8 592 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 C17orf107Q6ZR85 190 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SZRD1Q7Z422 152 aa12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms