RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 CCKARP32238 428 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 MC3RP41968 323 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PPICP45877 212 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 DIO3P55073 304 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM27E3Q08E93 113 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 GAB1Q13480 694 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 GGTA1PQ4G0N0 100 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM219BQ5XKK7 198 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 AAGABQ6PD74 315 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 TRPC4APQ8TEL6 797 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 KLHL29Q96CT2 875 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 MARK4Q96L34 752 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF681Q96N22 645 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 BTBD9Q96Q07 612 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ADOQ96SZ5 270 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 MED18Q9BUE0 208 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 NTMT1Q9BV86 223 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 BEX2Q9BXY8 128 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 VPS11Q9H270 941 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PRODH2Q9UF12 536 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 DSCAMO60469 2012 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 MED12LQ86YW9 2145 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 C17orf51A8MQB3 221 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP6CO00743 305 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 STX16O14662 325 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 HCRTR2O43614 444 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 REM1O75628 298 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PDYNP01213 254 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CHMP24386 653 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ACVR1BP36896 505 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ALDH9A1P49189 494 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CORO7P57737 925 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SCIMPQ6UWF3 145 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 NPSR1Q6W5P4 371 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF550Q7Z398 422 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 TMCO6Q96DC7 493 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 STARD4Q96DR4 205 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC35A4Q96G79 324 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 VSTM2LQ96N03 204 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 HBEGFQ99075 208 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF226Q9NYT6 803 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 XPR1Q9UBH6 696 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 HEY2Q9UBP5 337 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 DKKL1Q9UK85 242 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PSME2Q9UL46 239 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ESYT3A0FGR9 886 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC22A20A6NK97 555 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 TSPAN2O60636 221 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM24O75264 130 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CRHP06850 196 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 RBP1P09455 135 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CT45A8P0DMV1 189 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CT45A9P0DMV2 189 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 TSPAN8P19075 237 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 GRK2P25098 689 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 DPP4P27487 766 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CFPP27918 469 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CD79BP40259 229 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 MAGEA12P43365 314 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PCYT1AP49585 367 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 GAS1P54826 345 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CLDN15P56746 228 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 EFR3AQ14156 821 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2A2Q6IF42 318 aa8.49□□□□□ -1.05
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