RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	ACVR2A	P27037	513 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	GCK	P35557	465 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PMPCA	Q10713	525 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	STX5	Q13190	355 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ART3	Q13508	389 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	MPP2	Q14168	576 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	DECR1	Q16698	335 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PGS1	Q32NB8	556 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	XKR7	Q5GH72	579 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CES4A	Q5XG92	561 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	NUP43	Q8NFH3	380 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	GPR151	Q8TDV0	419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	FCRL1	Q96LA6	429 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SERHL	Q9NQF3	203 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CBLC	Q9ULV8	474 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PLOD2	O00469	737 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ADAM10	O14672	748 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN14	O95500	239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PRPS2	P11908	318 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	GABRA3	P34903	492 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	EIPR1	Q53HC9	387 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	EMC4	Q5J8M3	183 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CPTP	Q5TA50	214 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	GALNT10	Q86SR1	603 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	OR2L13	Q8N349	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PIK3R3	Q92569	461 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	RND1	Q92730	232 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	MTERF3	Q96E29	417 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	NUF2	Q9BZD4	464 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	DKKL1	Q9UK85	242 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GVC2	190 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PRB8	838 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SNPH	O15079	494 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GMFG	O60234	142 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TSPAN2	O60636	221 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	KCNH1	O95259	989 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	KIT	P10721	976 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	LAMP1	P11279	417 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	G6PD	P11413	515 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CYP4B1	P13584	511 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SOAT1	P35610	550 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PNLIPRP2	P54317	469 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	NUP107	P57740	925 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PSPH	P78330	225 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PSG6	Q00889	435 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	BST1	Q10588	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GAB1	Q13480	694 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CDSN	Q15517	529 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ACAD11	Q709F0	780 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT8	Q8WV74	236 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35A4	Q96G79	324 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PNPO	Q9NVS9	261 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25

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