RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	OR2L13	Q8N349	312 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	LIX1	Q8N485	282 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	KAT2A	Q92830	837 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TMCO6	Q96DC7	493 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	C14orf79	Q96F83	325 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	NODAL	Q96S42	347 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TIMP4	Q99727	224 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	EXO5	Q9H790	373 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SENP1	Q9P0U3	644 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	NTM	Q9P121	344 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SPG11	Q96JI7	2443 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	MED12	Q93074	2177 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TTC36	A6NLP5	189 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	UPK1A	O00322	258 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TYROBP	O43914	113 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	COQ9	O75208	318 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	EPPIN	O95925	133 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	CHEK2	O96017	543 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ACTL6A	O96019	429 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TACR1	P25103	407 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	MSX1	P28360	303 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SSTR2	P30874	369 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ETV4	P43268	484 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	MASP1	P48740	699 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	CORO7	P57737	925 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	PDE7A	Q13946	482 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	EFR3A	Q14156	821 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	NNAT	Q16517	81 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	DESI1	Q6ICB0	168 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	OR2T11	Q8NH01	316 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TMBIM1	Q969X1	311 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	MTERF3	Q96E29	417 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ELP4	Q96EB1	424 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	EGLN2	Q96KS0	407 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137		A0A0G2JNJ9	132 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	REM1	O75628	298 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TRAPPC6A	O75865	159 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TUBB	P07437	444 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	CHRNG	P07510	517 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	CPN1	P15169	458 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SDC1	P18827	310 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	NTS	P30990	170 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TIMP3	P35625	211 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ADH7	P40394	386 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	MAP3K8	P41279	467 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	MC3R	P41968	323 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ASMT	P46597	345 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TRPC1	P48995	793 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	GAS1	P54826	345 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	XKR7	Q5GH72	579 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ADO	Q96SZ5	270 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73

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