RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548098.1

ERGIC2-204, Transcript of ERGIC and golgi 2, humanhuman

TSL 2

Gene ERGIC2, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2-204ENST00000548098 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 CYP11B1P15538 503 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 IL2RGP31785 369 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 XCR1P46094 333 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 SLC6A8P48029 635 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 ALDH3B2P48448 385 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 POU3F4P49335 361 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 AP1B1Q10567 949 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 KIAA0040Q15053 153 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 AGKQ53H12 422 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 SLC10A5Q5PT55 438 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 VASH2Q86V25 355 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 CCDC51Q96ER9 411 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 B3GALT6Q96L58 329 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 ZIM3Q96PE6 472 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 TEX13BQ9BXU2 312 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 FZR1Q9UM11 496 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 MOKQ9UQ07 419 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 DHRS7Q9Y394 339 aa3.55□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 FRG2CA6NGY1 282 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 SLC17A2O00624 439 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 CXCL10P02778 98 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 PGK2P07205 417 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 ZNF19P17023 458 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 AHCYP23526 432 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 RFC2P35250 354 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 RGRP47804 291 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 NUMBP49757 651 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 SERTAD2Q14140 314 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 SLC22A10Q63ZE4 541 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 UBQLNLQ8IYU4 475 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 PRR22Q8IZ63 422 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 GPR137CQ8N3F9 429 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 OR52E1Q8NGJ3 308 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 CCDC26Q8TAB7 109 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 FAF2Q96CS3 445 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 THAP9Q9H5L6 903 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 FAM114A2Q9NRY5 505 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 DPM3Q9P2X0 92 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 MBD2Q9UBB5 411 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 KCNN3Q9UGI6 736 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 FETUBQ9UGM5 382 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 DNPEPQ9ULA0 475 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa3.54□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 H3BMH7 237 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 TOXO94900 526 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 P0C879 139 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 STK19P49842 368 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 MYBPC1Q00872 1141 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 PPP2R5CQ13362 524 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 ZNF79Q15937 498 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 PARP6Q2NL67 630 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 LGSNQ5TDP6 509 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 IL23RQ5VWK5 629 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 RABEPKQ7Z6M1 372 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 TAF8Q7Z7C8 310 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 RUFY1Q96T51 708 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 SYTL2Q9HCH5 934 aa3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
ERGIC2-204ENST00000548098 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 ARHGAP42A6NI28 874 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 H2AFZP0C0S5 128 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 ACVR1BP36896 505 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 IL9RQ01113 521 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 SRYQ05066 204 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 PUDPQ08623 228 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 OVGP1Q12889 678 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 IL18R1Q13478 541 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 RAB35Q15286 201 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 ZSWIM7Q19AV6 140 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 C1orf186Q6ZWK4 172 aa3.52□□□□□ -1.85
ERGIC2-204ENST00000548098 MIER3Q7Z3K6 550 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms