RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT73Q86Y46 540 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CFAP206Q8IYR0 622 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 OR4N4Q8N0Y3 316 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF619Q8N2I2 560 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 OR51F2Q8NH61 342 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TSLPQ969D9 159 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NT5C3BQ969T7 300 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NXNL1Q96CM4 212 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PSKH2Q96QS6 385 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NUDCD1Q96RS6 583 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CPXM1Q96SM3 734 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 UGT1A7Q9HAW7 530 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NINQ8N4C6 2090 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 MGAT4DA6NG13 374 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGAP42A6NI28 874 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SHISA9B4DS77 424 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CLDN34H7C241 214 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SGTAO43765 313 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC25A17O43808 307 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CLPXO76031 633 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CYC1P08574 325 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 DHRS4L1P0CG22 281 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT13P13646 458 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ITGALP20701 1170 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGAP25P42331 645 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 XCR1P46094 333 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 FABP6P51161 128 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC10A7Q0GE19 358 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 KIR2DS3Q14952 304 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PGS1Q32NB8 556 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 RAB6CQ53S08 254 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM209BQ5JX69 171 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PDPK2PQ6A1A2 396 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NPNTQ6UXI9 565 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 STAC2Q6ZMT1 411 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 RFX8Q6ZV50 586 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 P4HA3Q7Z4N8 544 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PGBD5Q8N414 524 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF527Q8NB42 609 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 OR2L2Q8NH16 312 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 LMO3Q8TAP4 145 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NAT14Q8WUY8 206 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM136AQ96C01 138 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 EPSTI1Q96J88 318 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC30A2Q9BRI3 323 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CCM2Q9BSQ5 444 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC39A8Q9C0K1 460 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 DRC3Q9H069 523 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 RAB6CQ9H0N0 254 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NARFLQ9H6Q4 476 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC19Q9H756 370 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SYNCQ9H7C4 482 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 MVB12BQ9H7P6 319 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NGBQ9NPG2 151 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TNFRSF19Q9NS68 423 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PDRG1Q9NUG6 133 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 DMAC2Q9NW81 257 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 C1RLQ9NZP8 487 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CLCF1Q9UBD9 225 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CHKBQ9Y259 395 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 MED12LQ86YW9 2145 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 UQCRHLA0A096LP55 91 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 DPRXA6NFQ7 191 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 A8MUA0 341 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 H0YIZ8 118 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 DFFAO00273 331 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TIPRLO75663 272 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ACSL3O95573 720 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NR3C1P04150 777 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 IGLL1P15814 213 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CA4P22748 312 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC16A1P53985 500 aa4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms