RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.36□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 NGBQ9NPG2 151 aa6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TBX18O95935 607 aa6.36□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 PRKCGP05129 697 aa6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.36□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 INCA1Q0VD86 236 aa6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 GPR176Q14439 515 aa6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PNCKQ6P2M8 343 aa6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 ITPKCQ96DU7 683 aa6.36□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 OR10A5Q9H207 317 aa6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 OR10A2Q9H208 303 aa6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.36□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 KCNK13Q9HB14 408 aa6.36□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 UGDHO60701 494 aa6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ZNF217O75362 1048 aa6.36□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 GCH1P30793 250 aa6.36□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 A0A0A6YYH2 397 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 A6NHS1 94 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 A6NJ64 397 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 RFPL2O75678 378 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ADAP00813 363 aa6.35□□□□□ -1.39
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