RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CARD18P57730 90 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF7P61962 342 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MFAP5Q13361 173 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 VEZF1Q14119 521 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TBCELQ5QJ74 424 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FCRL6Q6DN72 434 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR4F3Q6IEY1 312 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RNF175Q8N4F7 328 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM171Q8WVE6 324 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD49Q8WVL7 239 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 EPYCQ99645 322 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NECTIN3Q9NQS3 549 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MRGBPQ9NV56 204 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MED11Q9P086 117 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A7Q9Y694 548 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 A6NLC8 198 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FAM220BPB1ANY3 271 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KLF11O14901 512 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLC19A2O60779 497 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf47O95873 294 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FUCA1P04066 466 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 BPGMP07738 259 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PRR35P0CG20 571 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CPMP14384 443 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GABRA1P14867 456 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DNASE1P24855 282 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HTR1EP28566 365 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MC3RP41968 323 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 STARP49675 285 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ESRRGP62508 458 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SGCAQ16586 387 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GFOD2Q3B7J2 385 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO42Q6P3S6 717 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MICU2Q8IYU8 434 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MMP21Q8N119 569 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR5M1Q8NGP8 315 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLC2A12Q8TD20 617 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C19orf60Q96EN9 201 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR4K3Q96R72 315 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KCNA7Q96RP8 456 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GPR160Q9UJ42 338 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RAP2CQ9Y3L5 183 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KCNMB2Q9Y691 235 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PLCE1Q9P212 2302 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF25A6NGN4 478 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ENO4A6NNW6 628 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HCRTR1O43613 425 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF43P17038 809 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PPIBP23284 216 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SOX3P41225 446 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CSRP3P50461 194 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CAPZA1P52907 286 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PMS2P3Q13401 168 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR4D1Q15615 310 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC197Q8NCU1 140 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR6Y1Q8NGX8 325 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FAM81AQ8TBF8 368 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 AGAP11Q8TF27 550 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OMA1Q96E52 524 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RBP7Q96R05 134 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM2Q9C040 744 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 VCXQ9H320 206 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL31Q9H511 634 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 REEP4Q9H6H4 257 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 EMC3Q9P0I2 261 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa4.13□□□□□ -1.75
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