RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285896.10

CNOT8-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT8, Length 2,528 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-201ENST00000285896 ARAFP10398 606 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 ST6GAL1P15907 406 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 ZFP69Q49AA0 526 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 SLC38A4Q969I6 547 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 SLC38A3Q99624 504 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 LILRA5A6NI73 299 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 M0R082 166 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 B3GALT2O43825 422 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 GADD45AP24522 165 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 EPHA2P29317 976 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 CAPZBP47756 277 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 TP53BP2Q13625 1128 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 MANEAQ5SRI9 462 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 PHF11Q9UIL8 331 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 FABP3P05413 133 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 IGFBP5P24593 272 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 GRK5P34947 590 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 MVKQ03426 396 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 RFX4Q33E94 735 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 SZRD1Q7Z422 152 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 SETD9Q8NE22 299 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-201ENST00000285896 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 FAM20BO75063 409 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 PIAS2O75928 621 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 PROS1P07225 676 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 CPN2P22792 545 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 VLDLRP98155 873 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 IL1RL1Q01638 556 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 TNFRSF17Q02223 184 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 TSSK4Q6SA08 328 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 DOHHQ9BU89 302 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 ITPAQ9BY32 194 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 IL21RQ9HBE5 538 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 FAM60AQ9NP50 221 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 C14orf119Q9NWQ9 140 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 OPN1SWP03999 348 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 MPIP34949 423 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 KRT20P35900 424 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 DAPP51397 102 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 LIM2P55344 173 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 KCNJ10P78508 379 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 DUSP2Q05923 314 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 RUNX2Q13950 521 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 CEP68Q76N32 757 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 NUAK2Q9H093 628 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 DAPP1Q9UN19 280 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 A0A1W2PS29 197 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-201ENST00000285896 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms