RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638048.1

RASGEF1B-214, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 2,386 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-214ENST00000638048 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 PHF11Q9UIL8 331 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 EML5Q05BV3 1969 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 FAM234BA2RU67 622 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 K7ESF4 209 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 M0R233 179 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 CXCR6O00574 342 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 SGCEO43556 437 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 PRAMEF10O60809 474 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 SCELO95171 688 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 LALBAP00709 142 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 STSP08842 583 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 JUPP14923 745 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 SSTR2P30874 369 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 AKT2P31751 481 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 SLC19A1P41440 591 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 PFN3P60673 137 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 PPP2CBP62714 309 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 HERVK_113P63132 956 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 PPP2CAP67775 309 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 LAPTM4AQ15012 233 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 SNAPC1Q16533 368 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 DDI2Q5TDH0 399 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 IQCHQ86VS3 1027 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 STX12Q86Y82 276 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 SLC34A3Q8N130 599 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 DPP10Q8N608 796 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 OR2L2Q8NH16 312 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 OR52N1Q8NH53 320 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 GGHQ92820 318 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 USP7Q93009 1102 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 LINGO1Q96FE5 620 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 ZNF583Q96ND8 569 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 MGLLQ99685 303 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 MND1Q9BWT6 205 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 REG4Q9BYZ8 158 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 CD244Q9BZW8 370 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 AMBNQ9NP70 447 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 EMC7Q9NPA0 242 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 BIN3Q9NQY0 253 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 MGAT4DA6NG13 374 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 TBC1D3LB9A6J9 549 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 GFYI3L273 518 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 K7ESM1 405 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 FPGTO14772 594 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 CHP2O43745 196 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 GPX5O75715 221 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 MPC2O95563 127 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 IGHV4-34P06331 123 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 TBC1D3HP0C7X1 549 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 TDGF1P13385 188 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 STOMP27105 288 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 MAPK1P28482 360 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 EPHA2P29317 976 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 SSTR4P31391 388 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 CCR7P32248 378 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 ACSL1P33121 698 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 CXCL12P48061 93 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 CTSCP53634 463 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 FOXA1P55317 472 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 C2orf80Q0P641 193 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 NPRL3Q12980 569 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 NFATC4Q14934 902 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 FCN2Q15485 313 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 KLHL22Q53GT1 634 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 UNC50Q53HI1 259 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 HES5Q5TA89 166 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 KANK2Q63ZY3 851 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-214ENST00000638048 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms