RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, human

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3C3-211	ENST00000589550		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	MMP28	Q9H239	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550		A0A0J9YVX5	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	TPST2	O60704	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CIB2	O75838	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	OPN1LW	P04000	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	UQCRC2	P22695	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ERVK-16	P61578	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CAMK4	Q16566	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PARG	Q86W56	976 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	COQ2	Q96H96	371 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	EMCN	Q9ULC0	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PDLIM1	O00151	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	DUX1	O43812	170 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ECI2	O75521	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	SCGN	O76038	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	IGSF6	O95976	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ID1	P41134	155 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	GRIA1	P42261	906 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PHEX	P78562	749 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	DHODH	Q02127	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	LHX4	Q969G2	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	MED20	Q9H944	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	GALP	Q9UBC7	116 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-211	ENST00000589550		A0A1W2PNV4	684 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF724	A8MTY0	619 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PIK3C3-211	ENST00000589550		E9PBE3	544 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PIK3C3-211	ENST00000589550		K7EQD1	137 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PIK3C3-211	ENST00000589550	BTN3A3	O00478	584 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PIK3C3-211	ENST00000589550	INSIG1	O15503	277 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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